Olyan szupercellák, melyek kis (néhány km-es) függőleges kiterjedésűek, és horizontális méreteik is elmaradnak az átlagos szupercellákétól. Ezek általában olyan helyzetben jönnek létre, amikor a szükséges szélnyírás és a labilitás a légkör csupán alsó pár kilométerére szorítkozik (pl. télen vagy egy nyári helyzetben, amikor 4-5 km környékén erőteljes inverzió zárja le az alsóbb labilis rétegeket), így tulajdonképpen kisebb skálán jön létre ugyanaz, ami "normál" esetben a 10-15 km magasra felnyúló zivatarcellák esetében. Mindazonáltal a miniszupercellák is veszélyesek lehetnek, akár károkozó tornádót is képesek létrehozni, mint például az 1997. november 11-én Kunszentmárton térségében pusztító tornádó esetében.